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1分钟解答文献里的韦恩图怎么看?

2024-05-10 10:14:32
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今天给大家要分享的是韦恩图怎么看,主要从以下几个方面展开:韦恩图定义&用途、韦恩图具体怎么看(结合具体案例)、韦恩图相关疑问&解答。

一、定义&用途

 

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定义:韦恩图(Venn Diagram)是一种图形工具,主要用于展示和比较集合之间的关系。

用途:

常应用于基因组学和蛋白组学研究,例如:

l 用于分析不同个体间基因突变位点的共现情况

l 在药物安全性评估中,通过韦恩图监测不良事件的发生模式

l 比较不同组间的差异基因或差异蛋白,寻找它们之间的交集或并集

二、韦恩图具体怎么看

 

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在4种不同的肿瘤模型中(EMB、EPN、ATC、GNN)每种肿瘤类型相关的差异甲基化CpGs(dmcpg)的数量都很低。EMB中的dmcpg数量最多,有83.1%是特异性的。

三、相关疑问&解答

(1)韦恩图有哪些局限性(不适合展示哪些数据)?

l 有限的集合数量:韦恩图最适合用于描述2或3个集合之间的关系。当数据集>4组时,使用Upset图则更为合适。

l 不适合连续数据:韦恩图主要用于显示离散的集合元素,连续数据如时间序列或温度变化则不适用。

l 面积不准确:韦恩图中圆圈面积不总代表集合大小(圆圈的面积可能不是按比例缩放的)。

l 不适合比较比例:韦恩图不适合比较集合比例。若关注百分比或比例时,其他图表如饼图更适用。

l 不适用于大规模数据:大规模数据集使韦恩图混乱难解,此时其他可视化工具如树状图或热力图更合适。

(2)韦恩图的衍生图有哪些类型?

①韦恩图+标签

 

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②花瓣图

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③韦恩热图

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④网络韦恩图

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